1、培養器皿的清洗 培養器皿清洗后不僅要求透明、無污跡，而且不能殘留任何物質。某些化學物質僅殘留百萬分之一毫克，就會對細胞產生毒性作用。因此清洗質量的好壞直接影響到細胞培養成功與否，必須嚴格按照清洗的程序進行，以保證達到清洗的目的。一般玻璃器皿清洗的程序包括：浸泡、刷洗、浸酸和沖洗四個步驟。
(1) 浸泡
初次使用和培養用后的玻璃器皿都需先用清水浸泡，以使附著物軟化或溶解。新的玻璃器皿使用前應先用自來水簡單刷洗，然后用5%稀鹽酸溶液浸泡過夜，以中和其中的堿性物質。用過的玻璃器皿往往粘有大量蛋白質，干燥后不易刷洗掉，故用后立即浸入清水中刷洗。
(2) 刷洗
將浸泡后的玻璃器皿放到洗滌劑(不用含沙粒的洗衣粉)水中，用軟毛刷反復刷洗，注意不留死角，洗后晾干備浸酸。
(3) 浸酸
刷洗不掉的微量雜質經過濃硫酸和重鉻酸鉀清潔液的強氧化作用后，可被除掉，而且對玻璃器皿無腐蝕作用，去污能力很強，是清洗過程中關鍵的一環。清潔液是由重鉻酸鉀、濃硫酸和蒸餾水按一定比例配制而成。浸泡時，器皿要充滿清潔液，勿留氣泡。浸泡時間不應少于6小時，一般應浸泡過夜。
(4)沖洗
刷洗和浸酸后都必須用水充分沖洗，使之不留任何殘跡。沖洗宜用洗滌裝置，亦可用手工操作，每瓶都得用水灌滿，倒掉，重復十五次以上，后再用蒸餾水漂洗2～3次，晾干備用。
2、橡膠制品的清洗 新購置的橡膠制品帶有大量滑石粉應先用自來水沖洗干凈后，再作常規清洗處理。常規處理方法是：每次使用后的橡膠制品都要置入水中浸泡，以便集中處理和避免附著物干涸，然后用2%NaOH液煮沸10～20分鐘，以除掉培養中的蛋白質。自來水沖洗后，再用1%稀鹽酸浸泡30分鐘，后用自來水和蒸餾水各沖洗2～3次，晾干備用。用過的膠塞的清洗方法基本同清洗玻璃器皿，但膠塞刷洗的重點部位是膠塞使用面，逐個刷洗。
